IBKWU Politeknik Negeri Jember memiliki struktur kepengurusan sesuai Surat Keputusan Direktur Politeknik Negeri Jember Nomor 3131/PL17/KP/SK/2020 adalah sebagai berikut:

Kepala : Dr. Dhanang Eka Putra, SP, M.Sc

Sekretaris : Hariyono Rakhmad, S.Pd, M.Kom

General Manajer : Drs. Lukman Ekana Putra, P.Si., M. Si.

Manajer Teknologi Informasi : Nugroho Setyo Wibowo, S.T., M. T.

Manajer Kemitraan : Elly Antika, S.T., M. Kom.

Manajer Training & Business Class : Mukhamad Angga Gumilang, S. Pd., M. Eng.

Manajer Diseminasi Teknologi : Rindha Retina Darah Pertami, S. P., M. Si.

Manajer Pengembangan Produk: Silvia Oktavia Nur Yudiastuti, S.T.P., M.T.P.